El laboratorio dispone en su sede central del equipo e instrumental (tomamuestras, equipos de campo, campanas, esterilizadores, cromatógrafos, espectrofotómetros UV-Visible, Absorción Atómica, Plasma, I.C.P., Hornos, ionímetros, turbidímetros, viscosímetros, estufas, contadores, diluitores, equipos minividas para ensayos de bacterias etc….), necesarios para la realización de tomas de muestras y ensayos microbiológicos y físico-químicos en productos alimenticios y aguas, siguiendo las Metodologías Oficiales y/o recomendadas por organizaciones internacionales autorizadas (NORMAS EUROPEAS, NORMAS ISO, A.S.T.M., A.O.A.C., E.P.A., FOXFA,….). En los laboratorios de las delegaciones se dispone de equipos y materiales para tomas de muestras y realización de ensayos microbiológicos y pruebas físico-químicas básicas.

Dispone, así mismo, de equipos de toma de muestras y medición “in situ” y vehículos acondicionados para el transporte de muestras.